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登莱巡抚，那是在山陕巡抚之后，天下第二大巡抚，设置初衷，乃是为了防范倭寇骚扰北方沿海，后来倭患以去，便开始转而防范北方崛起的后金沿海路突袭京畿，几经废立几经收缩扩张，现在所辖范围及其广大，明天启元年设，全称“巡抚登莱地方赞理军务”或称山东海防巡抚，号防抚军门，有时简称“军门”，品秩为正四品，当时的登州镇总兵归登莱巡抚节制，可谓上马管军，下马管民，品级不大但实权不小。
最有做为的便是第二任袁可立，当时辽东半岛许多地方被后金占领。天启二年六月，袁可立接替陶朗先为登莱巡抚后，命令东江镇总兵毛文龙遣军攻打后金，相机规取金州、复州、永宁、旅顺一带。
随后，又在袁可立的策应下乘胜收复了辽东半岛南端的要塞旅顺，以及望海堡、红嘴堡。
金州和旅顺等地的收复，开辟了辽东战场的新局面。使登莱、旅顺、皮岛、宽叆连为一线，解除了后金占领区旅顺对山东半岛的军事威胁，令明朝的二千里海疆得到巩固，并完成了对后金的海上封锁，加重了后金占领区内粮食等战略物资的紧张状况。
如此一来，后金窘迫，毛文龙重要。
可惜好景不长，袁可立去官，接任巡抚李嵩，此人生在山西，上任后无限的发挥了他山西老抠的特点，对所有的钱粮，那是入则喜，出则庝。
而毛玉龙因为功高，为人又嚣张跋扈，跟登莱以及山东文官集团极不对付，这样事情就大条了。
原先袁可立在登莱巡抚任上的时候，皮岛还能按时接收山东调拨的钱粮军饷，但李嵩上任，第一件就认为毛玉龙虚报将士员额。在他想来，一个小小的皮岛，屁大的地方，怎么能有民二十五万，怎么能有兵四万？吃空额，绝对的吃空额，他这一生最恨的就是吃空额的。
于是，下令自己手下去皮岛清点兵额。
