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长官具体主管。此外，赈济、营建、水利等非常规支出，
若动支存留钱粮要事先请示朝廷，地方官府不得擅支。存留虽用于地方支出，但朝廷也实行必要的控制。常规支出要按朝廷的规定进行非常规支出则事先奏请，事后层层报户部，
接受审核。
朝廷对于地方官府控制的太严、太死，直接导致的后果就是地方官府采取种种手段，增加额外收入，加派，甚至于横征暴敛，从百姓手上刮地皮，搞上有政策，下有对策那一套嘛，被称为羡余引，这是地方官府独立支配的小金库，是各地起运以外的、诸项收人用于常规支出后的结余，主要是正额税外的赋敛
。
朝廷对于这些收入的来源、去处，其实是很难掌握的，据左都御史海瑞、总督仓场户部尚书王国光等人的奏报，地方官府的羡余来源主要有几个部分构成。
其一，存留田赋加耗。地方官府为了保证起运钱粮能够足数交解到户部，在朝廷的正项赋税之外，还会增加一部分额外的赋税，称之为加耗，名义上是为了运输这些钱粮而征收的运输，实则是地方官府的敛财之道，远多于储、运之损耗。甚至比朝廷的正项赋税都要高出很多。
其二，就是赃罚银，也就是地方官府在审理案件过程中，依照大明律可以赎刑的，予以收纳钱粮赎刑，但是实际上官吏们往往借由案件，敲诈勒索，赃罚之征虽有法律上的规定，事实上地方官往往多征。
