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轩辕氏回到部落，想道自己该做的均已做完。便想求长生之术，于是向广成子、玄女询问修道养生之法，如此数年后，轩辕写下了阴符经、黄帝太乙门入式诀、黄帝太一门入式秘诀、黄帝太一门逆顺生死诀。
以他的顺位，应该成为人皇，集人族天地人三皇之称，但是人皇之名为人族的共主，就算是以轩辕的功绩也不可能一直称自己是人皇。
所以自封黄帝，而修炼内功的集合为黄帝内经，黄帝内经里面包罗万象，有着公孙轩辕对于武道，仙道，医药，人体各种的了解，而其余的集合为黄帝外经。
当然，黄帝内经当中最为出名的就是黄帝自己研究出来的阴阳大道，御女成道，为了让自己的黄帝内经圆满，除了之前找的那几个妻子，加起来一共三千妻子。
一天，轩辕细数着自己的日子，细细算来已经一千一百多年了，离一千二百年已经快到了，但是他始终觉得自己还是缺了些什么，就连那些九黎之人还没有并入人族当中。
而蚩尤在押回来的那天就已经斩首了，却没想到斩首之后，蚩尤居然还没有死，突然一阵诡异的笑声响起，轩辕黄帝惊骇无比的望去，只见蚩尤那无头之躯根本没有流下一丝鲜血，那被斩下的头颅正在疯狂的大笑着
“哈哈哈公孙轩辕，本座早就说过，吾乃不死之身，即便是那轩辕圣剑也休想斩杀我蚩尤哈哈”
蚩尤笑罢，口中喃喃念诵着什么，那被斩落的头颅瞬间飞至断颈处光华一闪，再次紧密无间的联系在一起
轩辕黄帝看着这诡异无比的景象，心中没有丝毫的波澜，不过面上却是十分焦急，道：“蚩尤，即便你有此保命神通，今日你也死定了”言罢，再次挥动手中的轩辕圣剑将那蚩尤的头颅以及四肢斩下
